Si le développement des projets agricoles et ruraux se poursuit sur le rythme actuel, les objectifs fixés par les pouvoirs publics ne seront remplis qu'à moitié en 2020. Selon les dernières enquêtes (Source ADEME),  450 installations étaient en fonctionnement,  toutes filières confondues (méthanisation d'effluents de stations d'épuration urbaines, industrielles, traitement des biodéchets, déchets agricoles), en janvier 2016. Les unités rurales, agricoles et/ou territoriales, qui représentent un gros potentiel de développement, sont au nombre de 236. On est donc encore loin des objectifs du Plan autonomie méthanisation azote (EMAA) du Ministère de l'Agriculture, qui visait 1000 méthaniseurs en 2020, objectif pourtant modeste, compte tenu du potentiel et de la volonté des acteurs.